MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017775	AATA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017775	ATA	4	12	22	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017775	AAG	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017775	GA	3	6	49	54	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017775	GCTC	2	8	58	65	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017775	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017775	TAAAT	2	10	98	107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017775	A	7	7	123	129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017775	ATAAA	2	10	158	167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017775	T	7	7	175	181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017775	ATTC	2	8	225	232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017775	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017775	AAT	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017775	AGAA	2	8	275	282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017775	TTTA	2	8	961	968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017775	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017775	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017775	TA	3	6	1091	1096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017775	T	6	6	1103	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017775	A	7	7	1127	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017775	ATA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017775	CTTT	2	8	1237	1244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017775	AT	3	6	1263	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017775	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017775	A	9	9	1388	1396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017775	T	7	7	1409	1415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017775	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017775	TTA	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017775	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017775	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017775	CATAC	2	10	1485	1494	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017775	AAT	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017775	T	6	6	1531	1536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017775	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017775	AT	3	6	1583	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017775	A	6	6	1657	1662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017775	A	6	6	1673	1678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017775	TATT	2	8	1700	1707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017775	TG	3	6	1759	1764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017775	TTG	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017775	T	6	6	1845	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017775	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017775	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017775	T	6	6	2087	2092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017775	T	7	7	2100	2106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017775	T	6	6	2112	2117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017775	TGCT	2	8	2138	2145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017775	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017775	T	6	6	2165	2170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017775	TTTG	2	8	2174	2181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017775	T	6	6	2194	2199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017775	A	6	6	2203	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017775	T	7	7	2214	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017775	T	7	7	2245	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017775	ATTT	2	8	2252	2259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017775	T	8	8	2257	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017775	T	7	7	2267	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017775	T	7	7	2278	2284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017775	GTTT	2	8	2839	2846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017775	T	6	6	2867	2872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017775	A	6	6	2889	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017775	TA	3	6	2917	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017775	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017775	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017775	TA	3	6	2970	2975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017775	TATT	2	8	2998	3005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017775	TGA	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017775	ATTT	2	8	3030	3037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017775	AGG	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017775	AAG	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017775	TAA	2	6	3278	3283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017775	TA	4	8	4899	4906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017775	TA	5	10	4919	4928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017775	AT	3	6	4929	4934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017775	AAGT	2	8	4946	4953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017775	T	6	6	4964	4969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017775	TAG	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017775	TAA	3	9	5008	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017775	GA	3	6	5032	5037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017775	G	6	6	5052	5057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017775	TAT	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017775	TAAA	2	8	5073	5080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017775	AT	3	6	5081	5086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017775	AT	4	8	5088	5095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017775	TATAA	2	10	5106	5115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.